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中国科学院青藏高原研究所的岗位编制经历了一定的发展调整。2003年10月，院人教局发布的《关于下达2003年事业编制控制数的通知》(人教字〔2003〕43号)中，为研究所的拉萨部和北京部分配了相应的创新岗位编制名额。然而，随着研究所的发展和国家对青藏高原研究的重视程度提升，这一编制情况在2008年有了新的变化。
在当年9月的中科院第十次院长办公会议上，研究所的过去五年工作进展与未来发展战略进行了审议。会议认为，研究所的创新目标与国家经济社会发展的需求相契合，因此决定对编制进行调整。这一决定使得研究所的事业编制得到了显著增加，从最初的数额提升到了150名。这一扩编反映了对青藏高原研究工作的高度重视，也为研究所的科研工作提供了更为广阔的发展空间。
青藏高原研究所是根据国家经济社会发展重大战略需求，面向世界科学前沿，按照新的*和模式，经院党组决定，新组建的研究单元之一。2003年3月3日，中科院正式任命了青藏高原研究所的领导班子成员，12月2日，*机构编制委员会办公室复字〔2003〕165号文件《关于中国科学院青藏高原研究所等单位机构编制的批复》，正式批准了青藏高原研究所的成立。
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