浙江农林大学的东湖校区和衣锦校区在地理位置、规模以及开设的主要学院上存在差异。两个校区均位于浙江省杭州市临安区，但具体位置有所不同。
东湖校区位于临安区的武肃街666号，占地面积较大，达到了3200余亩，校舍建筑面积也相当可观，约为90余万平方米。相比之下，衣锦校区占地面积较小，仅为500.24亩，校舍建筑面积则为27余万平方米。
在学院设置方面，东湖校区的学科涵盖了农业与食品科学、林业与生物技术、环境与资源、工程、风景园林与建筑、旅游与健康、经济管理、文法（包括外国语、茶文化）、动物科技、动物医学以及马克思主义和艺术设计等多个领域。
而衣锦校区则侧重于信息工程、理学、集贤（创新创业）、国际教育、继续教育、农林干部管理等专业方向。
综上所述，尽管东湖校区和衣锦校区都在临安区，但它们在地理位置、规模和主要学院设置上存在明显区别。
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回答时间：2024-11-12 20:02
