热心网友
回答时间：2024-08-26 05:24
BLAST，全称为Basic Local Alignment Search Tool，是NCBI提供的序列相似性搜索工具。它将用户提供的核酸或蛋白质序列与公开数据库进行匹配，找出相似序列，具有在线和单机版两种使用方式。针对特定需求，如批量处理或涉及隐私保护，推荐下载单机版。
2. 算法参数：
- 基本参数如最大显示条目、短查询序列影响期望值和范围长度。
- 得分参数包括矩阵选择（如BLOSUM62）、空位成本和组成校正。
- 筛选和遮盖功能用于优化搜索结果。
比对结果重点关注5、8、9指标，如假设蛋白（hypothetical protein）、未命名蛋白（unnamed protein product）和未表征蛋白（putative uncharacterized protein）等，它们可能反映了潜在的生物功能或研究价值。
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